在控制轴流风扇转速时，PWM控制器和变频器具有不同的优缺点和适用场景。以下是它们之间的比较：

PWM控制器
优点：
PWM控制器具有体积小、成本低、控制精度高等优点。它可以通过调整脉冲宽度来控制电机的平均电压，从而实现对风扇转速的精确控制。
PWM控制器可以实现对风扇的快速启停和正反转控制，并且可以通过程序实现复杂的控制逻辑，如自动温度控制等。
PWM控制器与计算机接口方便，易于实现自动化控制。
缺点：
PWM控制器的输出为方波信号，其谐波分量较大，会对风扇产生一定的电磁干扰，并可能导致噪音问题。
PWM控制器的输出功率有限，无法驱动较大的轴流风扇。
变频器
优点：
变频器可以通过改变电源频率来控制电机的转速，因此可以实现对轴流风扇的平滑调速。
变频器的输出为正弦波信号，其谐波分量较小，对风扇的电磁干扰较小，且运行平稳。
变频器可以提供较大的输出功率，能够驱动较大的轴流风扇。
缺点：
变频器的体积较大，成本较高，需要专业的维护和调试。
变频器的控制精度较低，可能会对风扇的转速产生波动和不稳定现象。
变频器需要专业的技术人员进行调试和维护，对于普通用户来说不太友好。

综上所述，PWM控制器和变频器各有优缺点和适用场景。PWM控制器适用于对风扇转速精度要求较高、驱动功率较小的场景；而变频器适用于对风扇运行平稳性要求较高、驱动功率较大的场景。在选择控制轴流风扇转速的方法时，需要根据实际需求进行综合考虑。